يعد سمك قرش الحوت آخر الأنواع المتبقية، وصنف ضمن الكائنات الحية المهددة بالانقراض من قبل الاتحاد العالمي للحفاظ على الطبيعة ومواردها (IUCN)، مما يشير إلى انخفاض 50% من أعداده خلال الأجيال الثلاثة الماضية، ليدخل في صراع حاد لأجل الاستمرار.
عوامل تسهم في انخفاض أعداده:
- الصيد الجائر
- الصيد العرضي
- الاصطدام بالسفن والقوارب الملاحية
- تأثير المخلفات البحرية والتلوث